Curso corto de FreeSurfer
Descripción general
FreeSurfer es un paquete de software que permite analizar imágenes de resonancia magnética estructural; en otras palabras, permite cuantificar la cantidad de materia gris y blanca en regiones específicas del cerebro. También permite calcular mediciones como el grosor, la curvatura y el volumen de los diferentes tipos de tejido y correlacionarlas con covariables; o bien, contrastar estas mediciones estructurales entre grupos.
Ejemplo de un mapa típico a nivel de grupo creado por FreeSurfer. Este mapa se basa en un contraste a nivel de grupo entre dos grupos, donde los colores rojo y azul indican las diferencias en el grosor cortical entre los grupos. Normalmente, estos resultados se representan en cerebros inflados; el gris más oscuro representa los surcos y el gris más claro las circunvoluciones.
Este curso te mostrará cómo descargar e instalar FreeSurfer y cómo analizar un conjunto de datos de principio a fin. Aprenderás el vocabulario básico de FreeSurfer y cómo realizar preprocesamiento, edición de volumen y análisis de regiones de interés.
Análisis de principio a fin con FreeSurfer
- Tutorial de FreeSurfer n.° 1: Términos básicos
- Tutorial n.º 2 de FreeSurfer: Cómo descargar e instalar
- Tutorial n.º 3 de FreeSurfer: Reconocimiento total
- Tutorial de FreeSurfer n.° 4: Ejecución de recon-all en paralelo
- Tutorial n.º 5 de FreeSurfer: Cómo usar la cuadrícula de ciencia abierta
- Tutorial de FreeSurfer n.º 6: Freeview
- Tutorial de FreeSurfer n.° 7: El archivo FSGD
- Tutorial de FreeSurfer n.° 8: Análisis de grupo
- Tutorial de FreeSurfer n.° 9: Corrección de clústeres
- Tutorial de FreeSurfer n.° 10: Análisis de correlación
- Tutorial de FreeSurfer n.º 11: Análisis de la región de interés
- Tutorial de FreeSurfer n.° 12: Introducción a los modos de fallo
- Tutorial de FreeSurfer n.° 13: Errores en la superficie de la piel y en el cráneo
- Tutorial de FreeSurfer n.º 14: Puntos de control y normalización de la intensidad
- Apéndice A: Índice de girificación local
- Apéndice B: PETSurfer
- Apéndice C: Anotación de imágenes anatómicas con Freeview
- Apéndice D: Segmentación de los subcampos del hipocampo, la amígdala, el tronco encefálico y el tálamo