Introducción a MRtrix

¿Qué es MRtrix?

MRtrix es un paquete de software para analizar datos de difusión. Una de las ventajas notables de MRtrix sobre las técnicas de ajuste de tensores es su método de deconvolución esférica restringida, o CSD; este método deconvoluciona la señal de difusión en cada vóxel en una serie de haces de fibras superpuestos. Esto reduce el problema del cruce de fibras, que puede ser un factor de confusión al ajustar un tensor.

Además de una biblioteca de comandos creada por el equipo de MRtrix, el software también incluye contenedores para los comandos utilizados con FSL, en particular, los comandos topup y eddy. Si aún no lo ha hecho, descargue e instale el paquete de software fMRI FSL.

Objetivos de este curso

Este curso te enseñará los fundamentos de la difusión: cómo se recopila y cómo se analiza. Aprenderás a realizar análisis basados en fixels para cuantificar la densidad de fibras de materia blanca dentro de cada vóxel y a crear tractogramas mediante tractografía probabilística. Finalmente, aprenderás a crear conectomas y a visualizar la cantidad de fibras que conectan distintas regiones cerebrales.

Pasos de preprocesamiento